基因改造技術是生物技術中最具關鍵性的技術，靠這項技術，人類能製造出以前不存在的各種遺傳基因，得到具有特殊功能的生物，但如果被誤用或管理失當，也可能成為另一種污染源，為人類帶來禍害。
近年來許多人都注意到水果又大又甜，豆漿店幾乎都標榜原料非「基因改造」黃豆，但這些是真是假，消費者無法判斷，基因食品的安全性又是如何呢？
基因改造目的
所謂「基因改造」產品，就是利用近代分子生物（Molecular Biology）技術，將某些生物的基因轉接到其他物種，改造原有生物的遺傳物質，使其表現在形狀、營養價值、消費品質等，以符合人類的需求，有些基改產品可以直接食用，或者作為加工原料生產的食品，或者用以生產工業或醫藥等非食用產品。
以基因改造產品為原料進行加工所得的食品叫「基因食品」，其實此一名詞翻譯自英語Genetically Modified Food（GMO），如果直譯叫「基因改造食物」，也叫「轉基因食品」。
基因改造作物是基於生產者的利益，改變作物的栽種特性，以降低生產成本、提高產量；又分為抗減產型，即利用改造相關基因，如耐除草劑、抗不良環境、抗蟲害等基因，而達到正常的生產量；另一為抗熟型，藉由基因改造控制作物成熟有關的基因，使作物成熟期提前或延後，避開傳統的盛產期或季節性的問題，以供應市場需求。
國內外研發的基因改造食用植物有：木瓜、香蕉、西瓜、甜瓜、苦瓜、番茄、青花菜、毛豆、水稻（有黄金米等）、馬鈴薯，南瓜、甘藍、油菜、甜菜、粟米、苜蓿；觀賞植物，如菊花、玫瑰花、鬱金香、文心蘭、彩色海芋，非食用者有棉花等；基因改造動物，如牛、豬、乳羊等；基因改造水產生物，如泥鰍、鯰魚、九孔、草蝦、鮭魚、觀賞用的螢光魚等。
台灣的基因食品
台灣每年約進口250萬～300萬公噸的黄豆及200萬公噸左右的玉米，其中約有9成係基因改造，因此在台灣到處可看到基因改造產品，傳統市場所買食物有標示者甚少，因此基因改造食物原料在傳統市場到處可見，而超級市場有標示物品較多，但誠實標示基因改造者並不多，反而是標示非基因改造的產品日漸增加。
至於加工食品，9成以上都經基因改造，玉米罐頭、番茄醬、義大利麵醬等，以及市售標榜「生化」或「科技」的食品或便利商店所賣各項飲料及商品，大都是基因改造食品。在熟食方面，速食店的漢堡、薯條、湯及飲品等，也幾乎都是基因改造食品；夜市或路邊小吃攤所販賣的食物，使用的原料以基因改造者居多，因成本較低。
台灣目前僅規定基改黃豆或玉米為原料且占最終產品總重量5％以上者，應標示「基因改造」或「含基因改造」字樣，而二級加工品則不需標示，如醬油、沙拉油，嬰兒或老人蛋白營養品等，這些高級基因改造食材製品因為其內基因改造片段已不含基因改造，所以不用標示。
基因食品安全性沒問題？
2016年5月，美國國家科學研究院（United States National Academy of Sciences，NAS）發布報告中指出：「並無證據顯示基因改造作物製成的食品較非基改作物的食品不安全。」也就是說，基改作物對人類的健康影響和傳統作物沒有任何差異，也沒有決定性的證據，證明基改作物與環境問題有因果關係。
由於核酸成分的基因與蛋白質一旦進到腸胃裡，都會被酵素消化分解，成為氨基酸與核苷酸分子吸收，與日常生活的麵、飯、肉、菜等相同。所以，基改食物都是可分解的生物成分，與一般人所擔心的添加物，如農藥、抗生素、瘦肉精、防腐劑、塑化劑等不同，後者這些化學品，人類無法分解，甚至會累積在體內。
另外，基改大豆飼料餵食豬隻後，沒有發現轉植基因蛋白產物的殘留，乳牛食用基改大豆粕後，血液和乳汁中也測不到植入的基因蛋白，肉雞情況也相同，至今並沒有人或家畜吃了基改食物後產生不良影響的報告，所以從各種資料分析，基改玉米或大豆本身對動物應該無毒性。
基因食品安全性有問題？
基因改造作物可能對人體健康產生傷害，還有環境污染、生物多樣性、種子專利權、糧食主權、土地正義與國際外交等問題，加上各政府部門、跨國企業與學術機構之間的利益網絡，讓基因改造作物的安全性更形複雜。台灣國產硬質玉米也曾發現摻進日基改硬質玉米，造成污染。
2012年法國發表一篇基改玉米（NK603）對老鼠毒性的研究論文，餵食基改玉米的公母鼠都有顯著的慢性肝及腎的中毒病變，死亡率比對照組高出2～3倍；母鼠產生乳腺腫瘤的機率也比對照組高，腫瘤數目較多且大，結論指出：老鼠經長時間餵食基改玉米，對肝腎均有毒性，且有致癌性。
2000年，美國也發生食用玉米不慎混入飼料用基改玉米，並製成食品，引起數十起過敏案例。但最後食品藥品監督管理局（FDA）調查結果指出，基改玉米與這些過敏案例並沒有直接關係。
基因改造技術是生物技術中最具關鍵性的技術，靠這項技術，人類能製造出以前不存在的各種遺傳基因，得到具有特殊功能的生物，有如神話中的妖怪。目前主要是利用這些遺傳工程生物，來生產對人類有用的醫藥品、工業產品，但如果被誤用或管理失當，也可能成為另一種污染源，為人類帶來禍害。
遺傳基因是另類污染源，而且基因改造是違背自然的行為，人類必須重視這項污染所造成的生物災害。一般的物理性或化學性災害，對環境的污染有一定的限度，但引起生物災害的遺傳基因污染則不同，生物是活的，一旦污染了外界的環境，很可能繼續擴散而無法停止。
基因改造到底是福是禍，還難以有定論，基因食品有無安全性問題，目前也沒有確切答案。
